琼州海峡生态地球化学调查是 “全国土壤现状调查及污染防治”国家专项中近海海洋调查的内容，其目的是查明区内元素地球化学分布和分配特征，进行资源环境评价与基础地质研究，为全国及地方经济社会科学可持续发展和进行区域规划提供依据。广州海洋地质调查局受海南省地调院的委托，承担的琼州海峡底质采样工作。
    琼州海峡底质调查，是我国首次对整个海峡（三大海峡）进行底质调查和基础研究，其意义远不只是本项目最终要取得的成果，它将是海峡调查与研究工作起步的标志。广州海洋地质调查局在过去的近30 年中，曾多次在该海峡进行工程与环境调查，但都只是某个区域或港口或锚系点等，对琼州海峡的了解都较为局限。奋斗五号船本次执行琼州海峡底质采样任务，给我局提供了一次全面了解琼州海峡的机会。在海上调查中，现场体会海峡各个部位底质特征以及取样作业的难易情况；在航行中，了解整个海峡包括航道、各个港湾、浅滩等在内的适宜作业情况（航行、抛锚、渔业活动、潮流等），最后，通过与海南省地调院的成果共享，最终了解区内的底质地球化学分布特征以及基础地质情况。总之，通过这次的调查工作，可以为广州海洋地质调查局提供再次进入该区作业机会，积累较为详细的地质、水文、气象等资料，以及航海、作业经验。